pacman --needed -Sy bash pacman pacman-mirrors msys2-runtime

MSYS ~
$ pacman --needed -Sy bash pacman pacman-mirrors msys2-runtime
:: パッケージデータベースの同期中...
 mingw32                  224.1 KiB   483K/s 00:00 [#####################] 100%
 mingw32.sig               96.0   B  0.00B/s 00:00 [#####################] 100%
 mingw64                  223.0 KiB   719K/s 00:00 [#####################] 100%
 mingw64.sig               96.0   B  0.00B/s 00:00 [#####################] 100%
 msys                     126.1 KiB   814K/s 00:00 [#####################] 100%
 msys.sig                  96.0   B  0.00B/s 00:00 [#####################] 100%
警告: pacman-mirrors-20150722-2 は最新です -- スキップ
依存関係を解決しています...
衝突するパッケージがないか確認しています...

パッケージ (3) bash-4.3.042-2  msys2-runtime-2.4.0.16752.6eb10ef-1
               pacman-4.2.1.6258.f5bbd79-1

合計ダウンロード容量:   7.90 MiB
合計インストール容量:  43.09 MiB
最終的なアップグレード容量:   0.09 MiB

:: インストールを行いますか？ [Y/n]

:: パッケージを取得します ...
 msys2-runtime-2.4.0...     2.3 MiB  1255K/s 00:02 [#####################] 100%
 bash-4.3.042-2-x86_64   1865.2 KiB  1342K/s 00:01 [#####################] 100%
 pacman-4.2.1.6258.f...     3.8 MiB  1395K/s 00:03 [#####################] 100%
(3/3) キーリングのキーを確認                       [#####################] 100%
(3/3) パッケージの整合性をチェック                 [#####################] 100%
(3/3) パッケージファイルのロード                   [#####################] 100%
(3/3) ファイルの衝突をチェック                     [#####################] 100%
(3/3) 空き容量を確認                               [#####################] 100%
(1/3) 更新 msys2-runtime                           [#####################] 100%
(2/3) 更新 bash                                    [#####################] 100%
(3/3) 更新 pacman                                  [#####################] 100%

Update the system packages with
pacman --needed -Sy bash pacman pacman-mirrors msys2-runtime

Close MSYS2, run it again from Start menu and update the rest with
pacman -Su